如何获取目标基因的转录因子(上)
1、进入Ensembl主页后点击 BioMart 使用下拉框- CHOOSE DATASET - 选择数据库，我们选则 Ensembl Genes 93 ；这时出现新的下拉框- CHOOSE DATASET - ，选择目的物种，以 Human gene GRCh3p12 为例。
2、可以先预测一下该基因的promoter上潜在的转录因子结合位点。这应该有专门的软件可以分析。然后也可以做个转录因子芯片检查。
3、搜索基因序列，然后通过生物信息学分析寻找选录因子结合位点。再进行验证，寻找重要的转录因子。常用的生物信息学分析需要做UTR，转录因子结合位点，转录起始位点等等。
4、转录因子都是蛋白质，由基因指导其合成。问题的关键在于第一个转录因子哪里来 至于这个问题，颇有争议，一般的见解就是最开始出现的生命物质是RNA，而不是DNA，所以RNA直接变为蛋白质，而不用转录这一步骤。
ensembl数据库中的ensg是啥意思
1、名字错了当然没关系，只要序列正确就能用，一般来说，上游引物是正义链5端开始序列，下游引物是反义链5端序列从5端开始到3端比对一下，碱基顺序没错的话可以用，换个名字而已。
2、科研过程中我们经常会使用Ensembl（http：//asia.ensembl.org/index.html） 网站来获取物种的参考基因组，其中BioMart工具可以获取物种的基因注释信息，以及跨数据库的ID匹配和注释等。
3、IARS2-003指isoleucyl-tRNA synthetase 2基因003转录本。ENST00000490891是IARS2-003的transcript ID，OTTHUMT00000090763是另一个数据库对同一转录本的编号（Havana transcript）。
4、R语言中文本处理的重要一环，而R里面最强大的文本处理公式就是grep()一类的general函数(无需添加任何新的package)。
欧洲生物信息研究所简称
1、CBI全称Center for Bioinformatics。 北京大学生物信息中心（CBI）成立于1997年，是欧洲分子生物学网络组织EMBnet的中国国家节点。
2、information等等。二EBI(European Bioinformatics Institute)欧洲生物信息研究所The European Bioinformatics Institute（EBI）是目前国际上几个重要分子生物信息网站之一，位置座落于英国The Wellcome Trust Genome Campus。
3、欧洲生物信息学研究所(European Bioinformatics Institute，EBI)创建的一个核酸序列数据库。
4、欧洲生物信息研究所拥有超过20年生物信息学研究和服务经验，是全球收集和传播生物数据、提供免费生物信息服务的欧洲节点。
5、swiss-prot：最齐全的注释精炼的蛋白序列数据库，建立于1986年，1987年起由日内瓦大学(University of Geneva)医学生物化学系和 EMBL 数据馆(即现在的欧洲生物信息研究所EBI)共同维护。
6、美国国立生物技术信息中心，位于马里兰州的贝塞斯达，参议员Claude Pepper意识到信息计算机化过程方法对指导生物医学研究的重要性，发起了在1988年11月4日建立国立生物技术信息中心的立法。
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